結(jié)構(gòu)主義把結(jié)構(gòu)作為行動的決定因素，認(rèn)為結(jié)構(gòu)這種無法觀察到的自然或社會之物具有因果力，進(jìn)而探尋這種因果力及其歷史動力。這意味著它反對理性主義的原子簡化論，認(rèn)為社會行為不能僅僅通過受制于自身的物質(zhì)原子及其運動規(guī)律來加以解釋。例如，不應(yīng)只關(guān)注社會革命的暴力或政治沖突，而“應(yīng)該考察作為整體的革命，考察它們的許多復(fù)雜性”。而且，結(jié)構(gòu)主義將原因看作具有必然性的自然發(fā)生的因素，這意味著它不同于理性主義的演繹-通則式解釋法，不認(rèn)可那種通過必然性的實證主義來確定原因的邏輯。

　　以特定的本體論和方法論為基礎(chǔ)，各研究范式發(fā)展出了各自的比較方法。理性主義方法論視個體為理智的思考者，將人們的愛好與信念植根于物質(zhì)世界，將行動者作為思想實驗的實施者。因此，理性主義列出了針對思想實驗的“決定性”證據(jù)，這些證據(jù)是可證偽、可觀察的，也就是說，他們同時提出了無效假設(shè)和反例。例如，貝茨提出了一系列回歸等式，證明政治制度和公共政策影響著肯尼亞的糧食庫存，即制度的實施可能會將豐足轉(zhuǎn)變?yōu)轲囸~、將干旱轉(zhuǎn)化為糧食危機(jī)，并指出這種情況在許多發(fā)展中國家的農(nóng)業(yè)政治中是普遍存在的?？傊硇灾髁x秉持定量方法和一種實證主義的科學(xué)哲學(xué)，并試圖構(gòu)建一種知識結(jié)構(gòu)來對非理性行動進(jìn)行解釋。

　　文化主義通過對意義進(jìn)行比較分析來理解事物。由于意義是特定文化所特有的，所以文化主義主要進(jìn)行案例研究，認(rèn)為案例是獨特的，個案的特征是由歷史偶然性決定的，個體發(fā)展基本上是由不斷發(fā)生的歷史偶然事件所決定的。所以，文化分析路徑對跨個案的概括持否定態(tài)度，反對通則研究，認(rèn)為根據(jù)不同地域或社群的隨機(jī)樣本進(jìn)行研究，得出獨立于空間、時間和背景的概括，是難以成立的。理論和實驗不會在所有環(huán)境下都以完全相同的方式呈現(xiàn)，個案不是一般規(guī)律的表現(xiàn)，修正、例外和條件性才是常規(guī)現(xiàn)象。比較主義者不應(yīng)根據(jù)理想類型的理論和概念來進(jìn)行思考，因為它們并不存在。

　　結(jié)構(gòu)主義通過把社會結(jié)構(gòu)模式化來觀察各結(jié)構(gòu)之間的異同，據(jù)此把這些結(jié)構(gòu)模式劃分為不同的種類，從而使我們可以對這些特定的結(jié)構(gòu)種類進(jìn)行分析和概括。由于這種結(jié)構(gòu)劃分或結(jié)構(gòu)種類有其特定的適用范圍，既不是普遍主義的也不是特殊主義的，所以，結(jié)構(gòu)主義處于理性主義的普遍主義和文化主義的特殊主義之間，它的分析單位通常處于全體與個體、一般與特殊之間，是通過將個案劃分為不同的種類并建立起分類框架來達(dá)到概括目的的。所以，根據(jù)研究對象的內(nèi)容與形式即特定結(jié)構(gòu)種類進(jìn)行分類研究就是結(jié)構(gòu)主義比較方法的基本特征。